Sequenciamento de RNA (Análise de transcriptoma completo por NGS)​

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Características técnicas gerais:

Kit de preparação da biblioteca
Enriquecimento de RNA

Equipamento de
sequenciamento

MGIEasy RNA Library Prep
Inclui depleção de RNA
DNBSEQ-G400 (MGI)
Kit de preparação da biblioteca
MGIEasy RNA Library Prep
Enriquecimento de RNA
Inclui depleção de RNA
Equipamento de Enriquecimento
DNBSEQ-G400 (MGI)
MGIEasy RNA Library Prep
Inclui depleção de RNA
DNBSEQ-G400 (MGI)

Características técnicas

Output de sequência: 50M a 80M de reads por amostra Quantidade de reads customizável
Paired-End 100 pb
Qualidade: Q30>85%
Output de sequência: 50M a 80M de reads por amostra Quantidade de reads customizável
Paired-End 100 pb
Qualidade: Q30>85%

Tipos de amostras recebidas

RNA extraído

Placa de parafina (por ex.: tumor)

Requisitos da amostra
quando é enviado
RNA extraído

Concentração

Integridade por espectrometria (nanodrop)

RIN

200-400 ng

OD260/280=1.8~ 2.0, OD260/230≥2

≥7

Concentração

200-400 ng OD260

Integridade por espectrometria (nanodrop)

OD260/280=1.8~ 2.0, OD260/230≥2

RIN

≥7

Tempo de entrega

35 dias corridos

Arquivos entregues

Aplicações

  • Arquivos .fastq (dois a quatro arquivos por
    amostra).
  • Tamanho médio dos arquivos = 10-12Gb (Disponível ao usuário a partir de uma plataforma
    em nuvem).
  • Perfis de expressão gênica
  • Busca de novos transcritos
  • Fusão gênica
  • Modificações pós-tradução
  • Emenda de RNA
  • Isoformas de RNA únicas
  • Regulação gênica, entre outros

Arquivos entregues

  • Arquivos .fastq (dois a quatro arquivos por amostra)
 
  • Tamanho médio dos arquivos = 10-12Gb (Disponível ao usuário a partir de uma plataforma em nuvem)

Aplicações

  • Perfis de expressão gênica
  • Busca de novos transcritos
  • Fusão gênica
  • Modificações pós-tradução
  • Emenda de RNA
  • Isoformas de RNA únicas
  • Regulação gênica, entre outros

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