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Sequenciamento de RNA (Análise de transcriptoma completo por NGS)

Características técnicas gerais:

Kit de preparaçãoda
biblioteca

Enriquecimento de RNA

Equipamento de Enriquecimento
MGIEasy RNA Library Prep
Inclui depleção de RNA
DNBSEQ-G400 (MGI)

Características técnicas

Output de sequência:
50M a 80M de reads por amostra
Paired-End 100 pb
Qualidade: Q30>85%

Características técnicas gerais:

Kit de preparaçãoda
biblioteca
MGIEasy RNA Library Prep
Enriquecimento de RNA
Inclui depleção de RNA
Equipamento de Enriquecimento
DNBSEQ-G400 (MGI)

Características técnicas

Output de sequência:
50M a 80M de reads por amostra
Paired-End 100 pb
Qualidade: Q30>85%

Tipos de amostras recebidas

RNA Extraído

Bloco de parafina
(por ex.: tumor)

Requisitos da amostra
quando é enviado
RNA extraído

Concentração
Integridade por espectrometria (nanodrop)
RIN
Tempo de entrega

35 dias corridos

Arquivos entregues

  • Arquivos .fastq (dois a quatro arquivos por amostra)
  • Tamanho médio dos arquivos = 10-12Gb (Disponível ao usuário a partir de uma plataforma em nuvem)

Aplicações

  • Perfis de expressão gênica
  • Busca de novos transcritos
  • Fusão gênica
  • Modificações pós-tradução
  • Emenda de RNA
  • Isoformas de RNA únicas
  • Regulação gênica, entre outros

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